Los órganos de gobierno y administración de la Asociación Comarcal Gran Vega son:
– La ASAMBLEA GENERAL: órgano supremo integrado por todos/as los/as socios/as.
– La JUNTA DIRECTIVA: órgano ejecutor, rector y gestor de la Asociación, constituido por:
- Un/a Presidente/a.
- Un máximo de dos Vicepresidentes/as.
- Un/a Secretario/a.
- La Oficina Técnica de Gestión.
- Veintiocho Vocales (entre los que se nombrarán al Presidente y Vicepresidente/s).
– La OFICINA TÉCNICA.
– El CONSEJO TERRITORIAL.

La Junta Directiva de Gran Vega está compuesta por 28 miembros:
– Sección Entes Públicos (14 representantes de las Administraciones Locales): Los trece Ayuntamientos de la Comarca y la Exma. Diputación Provincial de Sevilla.
– Sección Entes Privados (14 representantes privados/as):
- 3 del sector agrícola,
- 3 del sector industrial,
- 3 del sector comercio y servicios,
- 3 del sector social y
- 2 de entidades sin ánimo de lucro.
– Sección Técnica: Secretario/a, Tesorero/a y Oficina Técnica de Gestión.